中心依托單位為南京大學和江蘇南大環(huán)保科技有限公司，2009年通過國家科技部組織的專家評審，正式批準組建(國科發(fā)計[2009]605號)，并于2013年11月以優(yōu)異的成績通過國家科技部組織的驗收。
中心瞄準國家重大需求以及工程技術(shù)學科國際發(fā)展前沿，以毒害有機污染物控制為導向，創(chuàng)新性地開展技術(shù)與工程裝備研發(fā)、成果轉(zhuǎn)化與產(chǎn)業(yè)化，發(fā)展新型戰(zhàn)略環(huán)保產(chǎn)業(yè)，推動我國傳統(tǒng)化工等行業(yè)轉(zhuǎn)型升級，努力成為國際一流的毒害有機污染物控制與資源化工程技術(shù)創(chuàng)新研究平臺，國際合作與技術(shù)交流中心和高層次創(chuàng)新人才培養(yǎng)基地。